prestonia,
я воспроизвёл вашу ситуацию с док1/док2 и шрифтами 9/12. Ситуация следующая. Если вы в доке-2 (откуда вы копируете текст) после последнего абзаца сделаете Enter, а затем уже Ctrl+a, то при вставке всё будет хорошо -- последний абзац со шрифтом 12. Суть проблемы легко понять если отобразить непечатаемые символы. Будет видно, что при выделении всего по Ctrl+a не происходит выделения последнего символа абзаца. Соответственно он не копируется и, как следствие, в том документе, куда текст скопирован, последний абзац оказывается завершённым символом абзаца, оставшимся от этого документа (куда копируется текст), соответственно, со шрифтом 9.
Возможно, это так и задумано, что последний в тексте символ абзаца не выделяется, но, по-моему, это таки баг. По крайней мере, я провёл ровно те же действия в MSO и там последний символ абзаца выделяется и копируется. Соответственно, описанного исходно вами поведения нет.