Ты какие-то действия, которые могли привести к удалению этих файлов, проводил?
gedit /home/pk/.local/share/indicators/application/ordering-override.keyfile
откроется пустой текстовый файл. Скопируй туда этот текст:
nm-applet=1
gnome-power-manager=2
ibus=3
gst-keyboard-xkb=4
gsd-keyboard-xkb=5
Сохрани и перейди в сессию.
Кто-нибудь посмотрите у себя содержание файла /usr/share/indicator-application/ordering-override.keyfile, а то я свой менял.