CoolAller,
Не нужно всю папку patches помещать, если в дебиане ее не было.
Просто создайте эту папку, положите в нее патч. А в текстовом файле series укажите имя патча.
Если там уже была папка patches, то просто добавьте патч и пропишите его в series. Обычно это делается через quilt, но можно и руками.
Но не факт, что патч применится к другой версии безболезненно. Может пройдет, а может и нет. Но это вы увидите при сборке.
Если не пройдет, то научу как сделать другой патч. Это элементрано на самом деле.