Да вроде порядок разделов в грубе значения не имеет, хотя я всегда прописывал их по порядку разделов:
sda1
sda2
sda3
sdb1
и т.д.
Раз вы шифруете весь диск да еще и с выносом бута, то может не заморачиваться и сделать вообще 1 раздел ?
И скрипт на рабочий стол для полного удаления системы в случае шухера=))
А если честно, то шифрование - ерунда всё это. Оно скорее всего приведет к потере своих данных, на крайний случай поможет в случае простой кражи компьютера. Воришкам не нужны данные с диска, им надо продать компьютер)) А вот от правоохранительных органов шифрование не спасёт. У них система расшифровки очень проста - противогаз на голову, шантаж, в особо сложных случаях - лекарственные препараты.
Если нужна анонимность, то лучше взять дистрибутив специально заточенный под это, сборок в сети полно, в том числе основанные на убунте. Например, Tails или Liberty. А можно собрать свою сборку на флешке (посмотрев какой софт установлен в том же tails), подметающую за собой следы и работать с загрузочной флешки.