Маловато приведенного кусочка лога для понимания проблемы. Видно, что не стартует Android NDK, но непонятно, почему. Либо криво установлен, либо поврежден, либо не удовлетворены зависимости. А путь к нему в проекте прописан в local.properties?
P.S. IMHO для NDK удобнее Eclipse + ADT. Студия - это для Java.