serega_sneg, собственно, все ответы даны выше. Подытоживая:
1) Если не отключать HDD с Windows, а GRUB ставить на второй винт, то GRUB увидит обе операционки и будет вариант выбора ОС.
2) Если отключить HDD с Windows, а GRUB так же ставить на второй винт, то GRUB
не увидит Windows (что логично, ведь винт отключен). Что бы увидел, надо после подключения первого винта с Windows, зайти в только что установленную Ubuntu, открыть Терминал и набрать
sudo update-grub
и перезагрузить компьютер.
В обоих вариантах, в BIOS/UEFI приоритет загрузки должен быть отдан второму винту, а GRUB установлен на винчестер, а не на раздел, то есть, к примеру, на sdb, а не на sdb1, sdb2 и т.д.
Если материнка с UEFI, то дополнительно читайте:
https://help.ubuntu.ru/wiki/руководство_по_ubuntu_desktop_14_04/особенности_установки_на_платы_с_uefi