В том смысле, что ядро серверной убунты скомпиллировано с PAE (Physical Address Extension). Это и есть поддержка более 3 ГБ оперативы на 32 бит. У вас есть 3 варианта:
1. Взять диск серверной убунты (то самое, что требует минимум телодвижений)
2. Пересобрать ядро с включенной поддержкой PAE (максимум телодвижений)
3. Взять Ubuntu 64 бит (тоже минимум телодвижений, но слышал, что в 64 бит линукс имеются кривые драйвера).
ЗЫ. Кажется, серверная убунта тоже собрана без PAE. Точно не помню. В любом случае, стоит попробовать взять 64 бит версию- она сработает без бубна. Ну, или ядро пересобирать в 32 бит и включить поддержку PAE....