Почти-что единственное действие, для которого запускаю GUI-файлменеджер - просмотр множества иконок-картинок.
И этого одного достаточно, чтобы понять, что работает оно непредсказуемо-неадекватно.
Во-первых, в настройках файлменеджера есть варианты, какие картинки как отображать.
Во-вторых, для обеспечения хоть какой-то предказуемости, перед запуском файлменеджера очистить каталоги ~/.cache/thumbnails, ~/.thumbnails.