На мой взгляд самая простая схема такая:
1. Разбить на два репозитория imsprog-editor и imsprog-programmer c CMakeLists.txt в корне
2. Сделать тэги версий (1.0.28)
3. Скачать сырые архивы с гитхаба (версионированные) в tar.gz (по дефолту ZIP, но ссылку можно руками отредактировать) и распаковать
4. Перейти в папку исходников, выполнить команду:
debmake
5. Мелкие изменения в debian/control (section, build-depends), debian/changelog (убрать номер issue)
6. Сборка из папки исходников
debuild -us -uc
debuild -S -us -uc
7. Profit
Заметил что установка идет в /opt, а должно с учетом настроек среды