ммм... скопировать данные на промежуточный носитель, сконвертить, скопировать назад...
p.s. кстате, идея появилась. дефрагментируешь диск, отрезаешь от него свободное место, создаешь новый раздел ехт2, копируешь на него сколько влезет, что осталось дефрагментируешь, отрезаешь свободное место, присоединяешь к уже существующему ехт2 разделу, повторяешь до полного удовлетворения.