cd experimental
#Создаём структуру каталогов
for i in $(find /home/data/Linux -type d | sed 's/\/home\/data\/Linux\///' | sed '1 d' | sed 's/ /\\/g'); do d=$(echo "$i" | sed 's/\\/ /g'); mkdir "$d"; done
# Создаём жёсткие ссылки
for i in $(find /home/data/Linux -type f | sed 's/ /\\/g'); do d=$(echo "$i" | sed 's/\/home\/data\/Linux\///' | sed 's/\\/ /g'); x=$(echo "$i" | sed 's/\\/ /g'); ln "$x" "$d"; done
Как-то так.
Можно конечно ещё отшлифовать, но суть думаю ясна.