Clonezilla и Remastersys отличные вещи. У меня бэкап делается следующим образом: в самом начале, как только установил и настроил систему, ставлю ремастерсис и создаю образ диска. Сохраняю образ в корне системы, которая стоит на внешнем винте и прописываю в грабе системы, которая на внешнем винте, подгрузку этого исошника. Потом где-то раз в месяц (как только наберется много изменений) создаю образ ремастером под тем же именем и подменяю старый исошник на новый на внешнем винте.
Всего пару раз мне нужно было восстановить кое-какие, случайно удаленные пацаном, документы. Просто примонтировал образ и копирнул. Полностью систему разворачивать из образа как-то не было необходимости, но несмотря на это полные образы делаю регулярно.