Хм. Встроенная графика мешать не будет. В конце концов, её всегда можно отключить средствами БИОС, опять же, если не будет хватать, купить отдельный адаптер и воткнуть всегда можно.
Вот на что я бы не смотрел - так это на всякие R версии чипсетов, ну, это которые типа RAID.