Навскидку, из моего личного опыта, порядка 90% зловредов можно вычистить руками без антивиря, тем более из под линукса, которому абсолютно фиолетово на атрибуты файлов в ntfs - скрытые они или системные. Подробно описывать лень, но если есть такая нужда сделаем, пишите.