Можно с live-cd gparted-ом попробовать(создать таблицу разделов вроде)
ТС, не делай так!ага, и лишиться оставшихся пока что разделов с виндой и всем, что на ней. советчики, блин!
если цель тупо перетереть мбр, то можно и просто первые 446 байт нулями забить, только ничего это не даст. от ошибки груба - да, избавимся, только грузиться оно от этого не станет. таки да fixmbr, описано много раз в подробностях