Ага, только что бы туда файлы положить, надо зайти в папку "/home/x/рабочий стол" и положить файлы.
А те файлы которые я создаю на рабочем столе появляются в папке "/root/рабочий стол".
Самое интересное - если я открываю папку находящеюся на рабочем столе открывается наутилус от рута и с правами рута, с настройками рута, а открывая папку из любого другого места открывается обычный мой наутилус, с обычными правами пользователя "х"