Поясню только относительно распаковки, относительно плагина и 64 бит не могу ничего сказать.
Какую команду в руте писать? 
Что значит "какую команду писать"? Вышеупомянутой командой
gksu nautilus
Вы запускаете Наутилус с правами суперпользователя (т.е. с расширенными правами, которых вам не хватало) и можете теперь редактировать содержимое системных директорий (которые защищены от обычных пользователей во избежание поломки системы), т.е. в этом же окне распаковываете и перемещаете по своим местам.
Эту команду для вызова Наутилуса от суперпользователя можно вводить как в окошке Alt+F2, так и просто в терминале.
З.Ы.
После использования рутовский Наутилус
сразу закрыть!