1) Для начала следует сделать то, что предлагает сама программа, т.е. выполнить
dmesg | tail
И, естественно, выведенную ошибку запостить сюда.
2) Точно такую же ошибку я исправлял банальным
sudo fsck /dev/sda1
Пусть не смущает, что диск не подмонтирован. При проверке fsck он и не должен быть.
Мне этой команды оказалось достаточно. Правда, пропавшие файлы надо будет искать в папке lost+found на восстанавливаемом диске.