Если вы их оставите: то любая программа сможет изменять любые компоненты в системе, т.к. вы останетесь под учеткой суперпользователя. А если вы отключите поваышенные, то у вас будет гораздо меньше прав и соответственно, если программе(вирусу например:)) что то потребуется изменить важное для системы она будет требовать повышение привилегий. Соответсвенно, если вы просто установили программу и делаете обычные дела возвращайтесь к обычным привлегиям, так как вероятность вреда системе совими ошибками резко снизите, а если надо выполнять много операций по важным измеениям системы оставьте повышенные.