Хорошо, тогда немножко по-другому.
Другая флешка имеется, что бы попробовать?
Если нет, загрузись с Live-CD Ubuntu, в терминале напиши sudo gparted.
Запуститься графическая утилита наподобии PartitionMagic, выбери свою флешку, снеси имеющиеся на ней разделы, отформатируй и делай наново live-usb.