Возможно нарушены файловые ассоциации!
Если так, то попробуйте переназначить чем открывать папку...
Откройте отдельно файловый менеджер (например введите в терминале nautilus, или найдите соответствующий пункт в меню).
Клик правой кнопкой мыши по любой папке -> "Свойства" -> "Открывать в". Ставим галочку против нормального обработчика. Видеоплеер же, из выбора вариантов, удаляем.
Если, каким-то образом, в выборе вариантов, значится только видеолеер, то его удаляем, и добавляем нормальный обработчик (в Ubuntu, вроде, обозван как "Открыть папку" (хотя может быть и "Nautilus", "Файловый менеджер Nautilus" или как-то так: у меня не Ubuntu)).
Если ничего подходящего в "списке известных приложений" (или как-то так) нет, то там есть текстовое поле в которое можно ввести слово nautilus. Сохранить. Если "галочка" против добавленного варианта для открытия не проставилась, то явно ее проставляем.