Собственно всем известно что в Unity трей работает мягко говоря странно,программы сворачиваютса неизвестно куда и как.
Ето легко исправить,дело в том что в Unity завели так называемый белый список приложений,все приложения не вошедшие в него не будут отображатса в трее.
делаем следующее
Смотрим список программ в списке
gsettings get com.canonical.Unity.Panel systray-whitelist
Теперь собственно добавляем свои
gsettings set com.canonical.Unity.Panel systray-whitelist "['JavaEmbeddedFrame', 'Wine', 'Dropbox']"
Для примера вот что прописано у меня
gsettings get com.canonical.Unity.Panel systray-whitelist
['JavaEmbeddedFrame', 'Wine', 'Dropbox', 'Mubmle', 'hp-systray', 'Pidgin', 'Radiotray', 'Skype']
Все радуемся!!!
Ну и вдобавок скриншот
