Нельзя сказать, что вопрос решен, но всё же проблема в том, что при установке "Emerald" именно такое происходит: исчезает верхняя часть рамки окна, где и находятся элементы "Свернуть", "Открыть" ...
Так что не вздумайте устанавливать "Emerald" под рабочий стол Unity...
А кто знает как настраивается Compiz в столе Unity, потому как я установил его, а при активации меня предупреждено, что подобные штучки уже установлены в Unity, но настроек их я так и не нашел. При замене на Compiz система не загружалась и пришлось переустанавливать заново...