Виндовые шрифты не будут нормально сглаживаться, потому что они заточены под своё кривое сглаживание. Больше всего со сглаживанием мне нравятся Ubuntu, Verdana, Liberation Sans.
Само по себе рабочее окружение не влияет на рендеринг шрифтов - это зависит от библиотек и настройки. И в во всех *buntu они одинаковы, надо только настроить сглаживание.
Совет: в браузере использовать тот шрифт, который хорошо выглядит на мониторе и запретить сайтам использовать свои шрифты.

Вот такое отображение шрифтов нормальное?