Если отдельно выделяли раздел под /home, то его просто не трогайте, а поставьте, чтоб монтировался в /home, все настройки сохранятся, только проги придётся докачать, но они уже будут настроены. Если не выделяли, то киньте всё, что там есть, на флешку, а потом кидайте туда же. Проги в любом случае лучше заново ставить.
З.Ы. А ещё, кстати, можно сделать swap-файл. Я как-то делал - у меня работало. В гугле инфу находил, думаю, и вы найдёте