я положил именно в /usr/share/applications, потому что мне надо, чтобы любой пользователь мог запустить эту программу обычным способом. И не создавать ярлыки запуска для каждого пользователя. А для того, чтобы и desktop-ярлык, и sh-скрипт не повторять вручную на других компах, разместил их в синхронизируемой папке пользователя-администратора, а в нужных местах ярлыки сделал на эти файлы.
Vovans, конструктивная критика -- это всегда хорошо. Если она конструктивная.