Качаем от
сюда.
Распаковываем.
Заходим в папку, которую распаковали. У меня так: .../FileZilla3/bin/.
Даем права на выполнение.
chmod +x filezilla
А дальше запускаем и радуемся жизни.
Потом делаем кнопку на рабочий стол и указываем путь к запускающему файлу. Можно ещё иконку FileZilla прилепить, но это уже по вкусу.