Вообще-то, для автомата надо файлы нумеровать для правильного склеивания, а перед склеиванием хорошо бы сортировать.
Если кусочков немного, то лучше их склеить не через автоматы. Так процесс более контролируем.
ЗЫ. Люди, что вы завелись из ерунды.
На любого спеца, всегда найдется суперспец,
на хитрую ж... найдется х.. с левой резьбой,
а на любого мудреца довольно простоты.(Ц)
ЗЫ2.
ТС, есть замечательная утилита
rename, которая вышла из перла и поэтому прекрасно поддерживает регулярные выражения.
Например,
... | rename 's/ /_/g'
заменит в именах файлов пробелы на подчеркивания.
Рекомендуется проделать всякие манипуляции по укорочению часто используемых директорий и убиранию в них пробелов. Например, "Рабочий стол" назвать "Desktop" или даже "Dt".