Изменять можно по разному, в том числе и удалить раздел, причём система в этом виновата не будет, так что вполне нормальное предупреждение. К тому же система не проверяет наличие бесперебойника. Наличие и его исправность.
Из практики: кромсал разделы и в хвост и в гриву, пока (тьфу-тьфу-тьфу) не разу данные не терял, но бекапы невосполнимой информации всё равно продолжаю делать.