К сожалению,в Гномшелле отключили возможность выставлять значки на рабочий стол. Почему-не понимаю.
Но можно выставить их в режиме "Обзор",в док сбоку Для этого перейдите во вкладку "Приложения",выберите нужное,кликните правой кнопкой мыши и в контекстном меню выберите пункт "Добавить в избранное". Убирать лишние иконки можно уже в доке,выбрав пункт "убрать из избранного".