Недавно специально загрузился с живой флешки и попробовал поставить nautilus. Моментально поменялось оформление рабочего стола и не только.
DM сами по себе не должны конфликтовать(если имеете ввиде gdm/kdm/lightdm), а вот настройки - да. Одни могут залезать на другие. Тот же наутилус меняет оформление, хотя не должен. Но видимо в гноме так было предусмотрено, а xfce всё, что можно продумано, каждое приложение отвечает за свои задачи.
Вообще самые основные проблемы: оформление, отказ работы некоторых функций приложения, быстродействие.
Я тоже сидел на ubuntu + xfce. И тоже ставил разные DE. Каково же моё удивление было, когда мне приходилось заходить в другого пользователя, чтобы в одну игру поиграть! Под моим пользователем всё работало намного медленнее. И ещё заметил: чем меньше файлов .хххх в ~, тем лучше.
Теперь вот сижу на почти чистой xubuntu 11,10 и не нарадуюсь.
Вы пока подождите, выйдет 12.04, там в xfce thunar должны довести до совершенства, а там и 4,10 можно будет поставить(если его не будет)