Вот так вызывается мой бэкап:
# DO NOT EDIT THIS FILE - edit the master and reinstall.
# (/tmp/crontab.pUBMD7/crontab installed on Sat Apr 7 08:29:23 2012)
# (Cron version -- $Id: crontab.c,v 2.13 1994/01/17 03:20:37 vixie Exp $)
0 * * * * /etc/webmin/bandwidth/rotate.pl
30 3 * * 0 /backups/backup.sh
Спасибо за совет, попробую залогировать процесс, возможно это прольёт свет.
Пользователь решил продолжить мысль 08 Апреля 2012, 12:54:00:
Попробовал с логом, но файл получается нулевой длины, что при запуске вручную, что через cron. С той разницей, что вручную всё отрабатывается до конца (получается нужный backup), а через cron паковка прерывается и скрипт начинает отрабатывает следующие команды. В общем, ситуация никак не прояснилась.