Я себе сейчас в похожем порядке буду ставить, и заранее предполагаю что, если буду сносить win то без вариантов, в обязательном порядке, ставить по новой всю ось, чтобы не парить зря филейную часть просиживая за бестолковым делом.
Это будет и проще и быстрей и проблем меньше вызовет.
Вот мой совет, все личные файлы, авторские, если нет еще одного харда(как в моем случае 500 Г. под торрент), записать на болванки, очень сомневаюсь что их наберется более 40 гигов, а 10 болванок с личной инфой еще и как бэкап, могут пригодиться в будущем. А потом смело удаляйте все к херам(это не орган, не мат, выражение такое, см.Словарь) и делайте все ровно и спокойно, как нормальный белый человек, зачем лишние танцы с бубном.
Весь софт можно поставить с нуля, он доступен из сети, не парьтесь зря по этому поводу, сохраняйте только то, что нельзя найти в сети.
+ Пока 12.04 на допиле лучше не торопится, а через пару месяцев уже и проблем меньше будет не только с самой осью но и совместимостью софта.
К тому времени, можно спокойно подготовиться и поставить все, что нужно и нужных версий и т.д. и т.п. .
Это, чисто мое мнение.