Угу, а форумы техподдержки создают для того, чтобы в них никто не задавал вопросов.
Но за /etc/default/keyboard спасибо.
Вопреки рецепту из вики, повторил в вышеозначенном файле настройки с ноутбука (прежние опции закомментированы):
#XKBVARIANT=","
XKBVARIANT=""
#XKBOPTIONS="grp:alt_shift_toggle,grp_led:scroll"
XKBOPTIONS=""
Теперь при любом сценарии входа работают ВСЕ настроенные в окне "Параметры системы"-> "Раскладка клавиатуры" сочетания клавиш.
Описанная в Wiki настройка XKBOPTIONS="grp:ctrl_shift_toggle,grp_led:scroll такого эффекта не дает, оказывая влияние только на переключение раскладки.