Я делаю проще обычно - качаю архивчик с playonlinux.com -
http://www.playonlinux.com/wine/binaries (выбираем нужное, linux-x86 или linux-amd64) во временный каталог. Далее распаковываю: tar -xvf PlayOnLinux-wine-1.1.22-linux-x86.pol.
Получаем несколько файлов и каталогов, нам нужно то, что лежит в каталоге wineversion, а именно каталог 1.3.22.
Кидаем в удобное место, например у меня лежит в /usr/local/lib/wine-pol
Делаем скрипт для запуска нужной программой нужной версией wine:
#!/bin/bash
WINEPREFIX=/usr/local/lib/wine-pol/1.3.22 /usr/local/lib/wine-pol/1.3.22/bin/wine bbcs_loader.exe
Можно сделать для каждой версии wine отдельный виртуальный диск С: а можно напихать внутрь каталога, в данном случае /usr/local/lib/wine-pol/1.3.22 cимлинков на /home/юзер/.wine/dosdevices и /home/юзер/.wine/wine_c. В общем, можно насоздавать более 9000 "бутылок" как связанных с основным системным wine общими каталогами и реестром, так и полностью изолированных.