Та же фигня - открывается по умолчанию в Rekonq. Поставил в настройках - открывать в Okular, пофигу - всё равно открывает в реконке. Самое интересное, что после удаления Rekonq, клик по файлу fb2 проводит к тому, что система вначале жалуется, что rekonq, мол, не установлен, только потом открывает в окуляре.