Ну да, все верно, по дефолту апач ищет сайты в директории /var/www, нужно перенастроить соответствующим образом, выше уже написали как это сделать. А так же, если этот раздел, на котором у вас лежит сайт не монтируется автоматически при загрузки системы, то сделайте так, чтобы монтировался.