Из стандартных ни одна не позволяет ставить какие-либо позиции самостоятельно. Мне даже не надо что бы программа умела играть , надо что бы она умела имитировать шахматную доску,фигуры,ходы ну и по возможности их записывать.
В принципе, подойдет и виндусовая, если нормально под WINE работает.