Устанавливать по инструкции (дополнительные драйвера) читать в тутошнем wiki, а если через .run- ругаться может или на неостановленый Х-сервер или на неправильную директорию/комманду. Разрешение после установки драйвера нужно настроить выполнив в терминале nvidia-settings или nvidia-xconfig (новый файл настроек), если не сделали при установке дров .run.