Довольно странная проблема. Корректно ли работает новая клавиатура (и другие USB устройства) в остальных (кроме доступа к шифрованному разделу) приложениях? Если работает\работают, то с некоторой долей вероятности можно предположить, что дело не в ядре и не его модулях, а именно в шифровании, привязанном к определённой клавиатуре. В таком случае гланды можно вырезать через альтернативное отверстие, а именно:
1. Скопировать информацию с щифрованного раздела на независимый носитель при подключённой старой клавиатуре.
2. Удалить шифрованный раздел.
3. Подключить новую клавиатуру, воссоздать шифрованный раздел и скопировать на него сохранённую информацию.
При этом важно сохранить прежние права на чтение\запись\исполнение файлов.