Для начала в терминале выполняете команду:
WINEARCH=win32 WINEPREFIX=~/Grahas-wine winecfg
У вас образуется новый префикс - папка
Grahas-wine и откроется окно настройки Wine, сразу выставьте настройки графики!
Устанавливаете программу:
env WINEPREFIX=~/Grahas-wine /usr/bin/wine /home/Ваш_профиль/Путь_до_установщика_программы/setup.exe
Программа установится в папку /home/Ваш_профиль/Grahas-wine/drive_c/Program Files/Ваша_программа
Запускать можно из терминала:
env WINEPREFIX=~/Grahas-wine /usr/bin/wine "/home/Ваш_профиль/Grahas-wine/drive_c/Program Files/Ваша_программа/grahas.exe"
Как то так
Может, при установке, выведется ярлычок на запуск программы, надо будет посмотреть, в нем, команду запуска на корректность пути к .exe файлу и если что - поправить.