Большое спасибо всем кто откликнулся. Скажу честно, корректно я с проблемой не разобрался. Думаю вся беда в ошибке дистрибутива.
Сначала попробовал поставить grub-efi. Выделил отдельный раздел на диске с типом EFI Boot, установил Ubuntu, но все равно ничего не заработало. Несмотря на то что мат. плата (ASUS, кстати, с UEFI) увидела загрузчик и определила его в биосе как "ubuntu", grub так и продолжил писать про некорректные magic ELF. И, естественно, не загрузился. Только теперь он пытался грузиться еще и с флешки с которой и ставилась система, опознавая ее, как (fd0) и упорно пытаясь к ней обратиться. Писал что-то вроде "disk not found"...
Как я решил проблему.
Снес раздел с EFI boot, опять сделал RAID1 из двух дисков. Загрузился с флэшки без UEFI и установил Ubuntu заново. Оказалось, что если грузишься с флешки череp UEFI раздел, созданный unetbootin, то и grub ставится EFI, а если с помощью обычной загрузки, то grub-pc. В итоге, после такой установки заработало все и сразу.
Думаю нужно разбираться с UEFI, но какой-то он глючный пока, на мой взгляд.