И не будет, у тебя в fstab uuid стоят, а другие программы обращаются к какому-нибудь sdax-в котором нет нужной инфы. Но это как вариант, не мещало бы проверить uuid.
PS. Boot отдельно, что за головняк?
какие другие то ??
проги должны обращаться к дереву куда монтируется раздел, а блочное устройство какие будут читать ?
насчет UUID я написал, что заменены на новые.
там до загрузки ядра дело не доходит... на BIOSе зависает.
наверно в грубе дело ?
boot отдельно нормальная практика
1. там не нужно журналирование
2. есть случаи когда он обязательно должен быть отдельно. типа Xen+lvm и прочее.
3. так надежнее, случись что с корнем хотя бы boot живой будет. BusyBox...