есть ещё предложение, но предупреждаю сразу, что не гарантирую правильную работу и функционал!
Можно просто не форматировать раздел и когда будет выдаваться предупреждение, то отказаться от форматирования. Тогда настройки и данные сохранятся, но могут быть проблемы и баги.
Есть и другое решение, более безопасное: удалить из корневого каталога всё, кроме каталогов /home и например, /opt. 3атем поделить раздел. И будет вам и /, и /home.