Здравствуйте. Очистил систему средствами Ubuntu Tweak.
Теперь, при сворачивании окон зависает вся система.
Вернее, если это окно последнее и после него будет показан рабочий стол, то по нажатии на кнопку minimize все встает в ступор.
Помогает лишь
sudo service lightdm restart
Сбросил compiz - не помогло. Есть еще предложения?

UPD: Проблема решена. Я случайно в той же Ubuntu Tweak отключил показ ярлыков рабочего стола.