Ubuntu 13.04, Gnome Fallback (классический без Unity), Compiz.
Возникает ситуация, описанная в названии темы, с некоторыми окнами (окно Центра приложений, окна Наутилуса, запущенные из меню "Переход"), в том числе не реагируют кнопки в углу. Вместо этого, любой клик по любому месту на заголовке приводит к сворачиванию окна, при чем если клик левый и выполнен над "крестиком", то закрывается окно, расположенное ниже. Логику выборочности пока не уяснил, равно как и решение)
Спасибо.
P.S. эффект исчезает, если воспользоваться контекстным меню вкладки на панели гнома, относящейся к данному окну ("восстановить прежний размер" например).