Я с раскладкой пробовал так: идем в "Параметры системы" -> "Ввод текста". Перед нами появится окошко (рисунок прилагается),
в этом окне, в самом низу, слева, стоит галочка "Показывать текущий источник ввода в панели меню", убираем ее и пытаемся присвоить сочетание клавиш, например "Ctrl+Shift". Если сочетание клавиш присвоились то ставим галочку обратно, что бы клавиши работали, если не сработало то убераем галочку, а потом ставим галочку на место и снова присваиваем клавиши. У меня так получилось, чему доказательство скриншот. А вот со скайп пока никак.