Про ncsa-auth первый раз слышу, но я конечно не гуру!
Brun правильно подсказывает! Копай sams, при скачке пакета и распаковке будешь приятно удивлена русской инструкцией, она конечно не идеальна ? но всетаки немного лучше чем инструкция на самом оф. сайте (что меня кстати удивило)!
Лично я на фряхе (FreeBSD) настраивал через NTLM аутентификацию, У меня и самс и сквид получал из виндового домена пользователей и группы, и плюс ко всему можно настроить сквид таким оброзом, чтобы управлять доступом к интернету через виндовый домен, т.е. пихаешь допустим одних пользователей в "user", а других в "Admin" и группе юзеров выдаешь ограниченный доступ (всякием там порно, варез, однокласники и т.д. режешь с помощью сквидгуэрд к примеру) ... ну и так далее!
А чтобы логин и пароль запрашивало, ntlm или другая авторизация не нужно! Достаточно настроить винбинд и керберос на пересылку запросов в домен, а аутентификация нужна для автомата!
Вроде бы ничего не перепутал!
Все в твоих руках!!!