Ну прямо таки ни как, можно же скрипт написать, при запуске которого будет завершаться в начале работа Firefox, а затем завершение работы ОС. Но наверное способ выключения ПК в этом случае измениться, так как надо будет запускать скрипт, а не штатно завершать работу ОС, и конечно городить такие сложности из за такой ерунды кажется глупым, но если уж хочется, то можно. Можно запуск скрипта повесить на горячие клавиши, однако, менеджер наверняка всё равно по привычке будет как обычно выключать ПК, как минимум через раз, и по сути ситуация может остаться прежней. Firefox например корректно завершает свою работу с помощью команды
pkill -15 firefox
а вообще если такой способ вас заинтересует, то это уже наверное отдельная тема...