Список файлов на удаление сохранить в отдельный файл (в линуксе почти все "текстовые"), например del_files.list. Построчно, т.е. каждый файл на отдельной строке. Если присутствует символ «звёздочка» (*) , то его надо экранировать «обратным слэшем» (\) или всю строку заключать в «кавычки» ("). Напоминаю, на всякий случай, что в Линукс пути прописываются «простыми слэшами» (/), например system/app/Term.apk
zip это команда, zip-file — это Ваш «zip-файл прошивки CyanogenMod для смартфона SGSII».
Полный листинг — это список всех файлов в архиве, а не только тех, что надо удалить:unzip -l zip-file